Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms