Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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