Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3TTJ4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms