Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uri1Q3TLD5 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uri1Q3TLD5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms