Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms