Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trappc13Q3TIR1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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