Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Shroom4Q1W617 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Shroom4Q1W617 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Shroom4Q1W617 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shroom4Q1W617 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Shroom4Q1W617 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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