Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ptchd1Q14B62 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ptchd1Q14B62 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ptchd1Q14B62 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ptchd1Q14B62 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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