Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cpne7Q0VE82 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne7Q0VE82 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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