Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
StumQ0VBF8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms