Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms