Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc4Q08624 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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