Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINDOCQ05AH6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINDOCQ05AH6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms