Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprgQ05909 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms