Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcad1Q04692 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms