Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms