Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GscQ02591 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GscQ02591 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GscQ02591 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GscQ02591 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GscQ02591 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms