Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VcpQ01853 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VcpQ01853 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms