Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd1Q01822 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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