Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme2Q01768 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms