Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms