Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms