Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms