Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms