Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smarcc1P97496 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smarcc1P97496 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms