Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms