Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SmsP97355 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SmsP97355 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmsP97355 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SmsP97355 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SmsP97355 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SmsP97355 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms