Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tubg1P83887 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tubg1P83887 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms