Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Otx2P80206 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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