Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otx1P80205 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms