Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms