Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms