Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rab3cP62823 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rab3cP62823 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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