Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gabra1P62812 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gabra1P62812 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms