Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms