Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp46P62069 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp46P62069 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms