Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Lmo4P61969 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Lmo4P61969 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms