Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PlnP61014 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PlnP61014 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PlnP61014 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PlnP61014 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms