Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms