Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scarf2P59222 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scarf2P59222 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scarf2P59222 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scarf2P59222 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarf2P59222 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarf2P59222 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms