Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhbdl3P58873 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms