Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdgP56581 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TdgP56581 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms