Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Defb1P56386 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defb1P56386 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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