Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NcanP55066 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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