Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb3P54285 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms