Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SqleP52019 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SqleP52019 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SqleP52019 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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SqleP52019 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SqleP52019 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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