Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TspoP50637 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TspoP50637 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TspoP50637 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TspoP50637 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms