Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FmodP50608 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms