Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms