Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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